Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms