Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms