Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF3P57682 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF3P57682 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF3P57682 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF3P57682 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF3P57682 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF3P57682 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF3P57682 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF3P57682 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF3P57682 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms