Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms