Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN12P56749 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLDN12P56749 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms