Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIM2P55344 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIM2P55344 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIM2P55344 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIM2P55344 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIM2P55344 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIM2P55344 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIM2P55344 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIM2P55344 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms