Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms