Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA3P52797 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms