Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A2P52657 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms