Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC6A9P48067 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms