Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms