Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM23P36406 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms