Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCVRNP35243 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCVRNP35243 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms