Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC27P30260 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC27P30260 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC27P30260 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC27P30260 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms