Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERPINB3P29508 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms