Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTX3P26022 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTX3P26022 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms