Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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