Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms