Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF3P18847 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF3P18847 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATF3P18847 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATF3P18847 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATF3P18847 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms