Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms