Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA2P17301 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA2P17301 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms