Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFAP15692 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms