Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms