Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms