Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLUP10909 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLUP10909 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLUP10909 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms