Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP10P09238 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP10P09238 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP10P09238 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP10P09238 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP10P09238 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP10P09238 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP10P09238 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms