Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms