Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-9P01782 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms