Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD2O96028 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms