Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CBX7O95931 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX7O95931 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX7O95931 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX7O95931 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX7O95931 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX7O95931 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX7O95931 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CBX7O95931 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CBX7O95931 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms