Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POP4O95707 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POP4O95707 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POP4O95707 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POP4O95707 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms