Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNSO60931 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNSO60931 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms