Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD4O60885 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD4O60885 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms