Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTATSF1O43719 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms