Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms