Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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