Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTSS1O43312 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTSS1O43312 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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