Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP3O43295 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms