Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF1O43189 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF1O43189 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms