Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms