Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms