Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms