Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf170A2RU37 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms