Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms