Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms