Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRG3Q9Y2Y8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRG3Q9Y2Y8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms