Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR1DQ9Y2S0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms