Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED23Q9ULK4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED23Q9ULK4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms