Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms