Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms